Zarówno w centrum Panamy jak i w większych miastach tego kraju nie występują żadne zagrożenia sanitarno-epidemiologiczne, w związku z czym służba zdrowia nie wymaga od nas wcześniejszego zaszczepienia się. Zagrożenia epidemiologiczne występują w zachodnich prowincjach Panamy, w szczególności w miejscowościach Bocas del Toro i Chiriqui, które zlokalizowane są przy granicy z Kostaryką. W tych regionach znajduję się ognisko groźnej choroby zakaźnej zwanej dengą, której głównymi nosicielami są komary. Co najgorsze nie wynaleziono szczepionki uodparniającej na wirusa, a trzykrotne ukąszenie przez owada może spowodować śmierć. W tym regionie odkryto również siedliska malarii i żółtej febry.

Ogromnym zagrożeniem dla turystów jest wysoki wskaźnik przestępczości w Panamie. Dosłownie w każdym miejscu grasują gangi, trudniące się napadami i kradzieżą. Powszechnie mówi się, że do najniebezpieczniejszych części stolicy kraju należy starówka miasta, tzw. Casco Viejo, a także najbiedniejsze dzielnice Panamy – Curundu i Chorillo, jednak Panama ogólnie jest niebezpiecznym krajem i najprościej jest uważać na każdym kroku. Będąc na wczasach w tym egzotycznym kraju, trzeba omijać z daleka takie miejscowości jak Colon, Darien.