Turyści wybierający się do Madagaskaru muszą obowiązkowo zaszczepić się przeciwko żółtej febrze.Do zalecanych należą szczepienia na:wirusowe zapalenie wątroby typu A i B, błonicę, tężec, polio,dur brzuszny.

W nabrzeżnej części kraju istnieje spore ryzyko zachorowania na malarię, także należy pić wodę wyłącznie butelkowaną.

Opieka medyczna na Madagaskarze nie stoi na najwyższym poziomie i często nie spełnia zachodnich standardów.W przypadku kłopotów zdrowotnych najbezpieczniej jest szukać opieki w szpitalach i przychodniach w stolicy kraju, gdzie pracuje wielu zagranicznych lekarzy. Szczególnie godny polecenia jest Kościół Adwentystów Dnia Siódmego.

Przed wyjazdem należy koniecznie pamiętać o zakupieniu międzynarodowego ubezpieczenia zdrowotnego.