Kenia leży zasięgu klimatu równikowego monsunowego z wyrównanym przebiegiem temperatur w ciągu całego roku. Klimat jest różnicowany w zależności od regionu. Na wybrzeżu, w pasie do 40 km i w górach – wilgotny, na pozostałym obszarze – suchy. Na nizinnym wschodzie występuje tylko jedna pora deszczowa, od kwietnia do czerwca. Na pozostałym obszarze dwie pory deszczowe, pierwsza od marca do maja, druga pora deszczowa jest krótsza, występuje w listopadzie i grudniu. Średnia temperatura miesięczna wynosi od 25-28°C na wybrzeżu, do 15-19°C w górach. Świetna pogoda sprawia, że właściwie w każdej chwili możemy zdecydować się na wycieczkę last minute.

Ze względu na dużą różnice wysokości klimat Kenii możemy podzielić na 4 strefy. Wybrzeże oceanu indyjskiego przez cały rok jest ciepłe i wilgotne łagodzone przez mocne bryzy morskie. Średnie miesięczne temperatury wahają się od 32°C w marcu do 20°C w sierpniu. Najbardziej deszczowe miesiące to kwiecień i maj. Północna Kenia to obszar suchy i jałowy z wysokimi temperaturami. Na równinach temperatury często sięgają 40°C.Wyżyny na zachodzie kraju w większości położone na wysokości od 1200 do 2200 m.charakteryzują dwa okresy deszczowe. Opady przypadają tutaj na kwiecień i maj oraz na październik i grudzień. Region jeziora Wiktoria jest najbardziej deszczowy w całej Kenii. Położona w tym regionie stolica Nairobi leży na wysokości 1661 m.n.p.m., dzięki swojemu usytuowaniu klimat w stolicy mimo jej położenia blisko równika jest stosunkowo chłodny.

Wulkaniczny masyw o wysokości powyżej 2500 m.n.p.m. to zupełnie inne oblicze Kenii. W najwyższych partiach gór śnieg leży przez cały rok.